Однозначно, ржавчину на кузове нужно зачистить до чистого метала и обработать преобразователем, лучше цинком.
Если есть сквозная ржавчина, то идеальный вариант - менять пороги, прозеваешь за порогами - пойдут усилители, внутренний порог и полик... а за усилителями машину начнёт ломать, трещины по углам лобового и заднего стёкол и по стойкам дверей, двери плохо закрываться начнут...
Если делают на продажу или на время, то сквозную ржавчину заделывают шпаклевкой со стекловолокном, потом проливают пороги пушечным салом, оптимальный вариант - нагретым до состояния молока... Обрабатывается при помощи любого нагнетателя, можно использовать малый газовый баллон с автомобильным штуцером и выходом под шланг, в конец шланга вставляется эмульсионный колодец от классики, только в торце сверлится дополнительное отверстие 1-1,5мм. И через заглушку в арке заднего колеса обрабатываешь порог.
Только после обработки обязательно нужно прогрунтовать порог с внешней стороны по местам ржавчины, по возможности прокрасить ну и уже только потом обработать «бесшумкой» или «антигравием».